Искусственный интеллект в обработке и анализе медицинских МРТ-снимков с использованием OpenCV
Шрифт:
Металлические протезы суставов
Искусственные клапаны сердца
Имплантируемый дефибриллятор сердца
Имплантированные инфузионные насосы
Имплантированные нервные стимуляторы
Кардиостимулятор
Металлические зажимы
Металлические булавки, винты, пластины, стенты или хирургические
Кохлеарные имплантаты
Пуля, осколок или любой другой тип металлического фрагмента
Внутриматочная спираль
Если у вас есть татуировки или перманентный макияж, спросите своего врача, могут ли они повлиять на вашу МРТ. Некоторые типы чернил содержат металл.
Беременность является относительным противопоказанием к МРТ. Влияние магнитных полей на плод недостаточно изучено. Ваш врач может порекомендовать вам альтернативное обследование или отложить МРТ. Также сообщите своему врачу, если вы кормите грудью, особенно если вы хотите проходите процедуру с контрастированием.
Также важно обсудить с врачом и технологом МРТ проблемы с почками или печенью, потому что проблемы с этими органами могут ограничивать использование инъекционных контрастных веществ во время сканирования.
Подготовка к МРТ
Если не указано иное, то перед обследованием МРТ разрешается принимать пищу и лекарства. Обычно вас просят убрать вещи, которые могут повлиять на получаемое изображение, например:
Ювелирные украшения
Заколки для волос
Очки
Часы
Парики
Протезы
Слуховые аппараты
Бюстгальтеры на косточках
Косметику, содержащаю металлические частицы
Как проходит МРТ?
Во время теста
Вы ложитесь на подвижный стол, который продвигается в аппарат МРТ. Технолог следит за вами из другой комнаты. Вы можете говорить с человеком через микрофон.
Если у вас есть страх замкнутых пространств (клаустрофобия), вам могут дать успокоительное. Большинство людей легко переносят процедуру.
Аппарат МРТ создает сильное магнитное поле вокруг вас, а радиоволны направлены на ваше тело. Процедура безболезненная. Вы не чувствуете магнитное поле или радиоволны, и вокруг вас нет движущихся частей.
Во время МРТ-сканирования внутренняя часть магнита производит повторяющиеся постукивания, удары и другие шумы. Современные апараты обладают встроенной системой шумоподавления.
В
МРТ может длиться от 15 минут до часа. Вы не должны двигаться, чтобы изображение не получилось размытым.
Во время функциональной МРТ вас могут попросить выполнить ряд небольших задач – например, двигать большим пальцем или отвечать на простые вопросы. Это помогает точно определить части вашего мозга, которые контролируют эти действия.
После теста
Вы можете возобновить свою обычную деятельность сразу после сканирования.
Результаты магнитно-резонансной томография
Подготовленный для интерпретации данных МРТ специалист (рентгенолог), проанализирует полученные при сканировании изображения, и сообщит о результатах. Ваш врач обсудит с вами следующие шаги.
Глава 2: Предварительная обработка изображений
2.1 Загрузка и отображение МРТ снимков
При работе с медицинскими МРТ снимками важно знать, как загрузить и отобразить их с помощью OpenCV. Мы рассмотрим основные шаги для загрузки МРТ снимков в формате DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine) и их отображения на экране. DICOM является стандартом для обработки, хранения и передачи медицинских изображений, и многие МРТ снимки используют этот формат.
Для загрузки и отображения МРТ снимков в формате DICOM с использованием библиотеки OpenCV вам понадобятся следующие шаги:
1. Установка библиотек: Убедитесь, что у вас установлена библиотека OpenCV. Вы можете использовать пакетный менеджер вашей операционной системы или установить OpenCV вручную.
2. Загрузка DICOM файлов: DICOM файлы медицинских изображений обычно представлены в виде серии файлов, хранящихся в одной директории. Вам потребуется функция для загрузки DICOM файлов. В Python вы можете использовать библиотеку pydicom для чтения DICOM файлов. Вот пример кода для загрузки серии DICOM файлов:
``` python
import os
import pydicom
def load_dicom_series(directory):
dicom_files = [os.path.join(directory, file) for file in os.listdir(directory) if file.endswith(".dcm")]
dicom_files.sort # Сортируем файлы в правильном порядке
slices = [pydicom.dcmread(file) for file in dicom_files] # Чтение DICOM файлов
return slices
```
3. Извлечение данных из DICOM файлов: DICOM файлы содержат метаданные и пиксельные данные снимков. Вы можете извлечь пиксельные данные, а также другую информацию, такую как интенсивность окна, положение и ориентацию снимков. Вот пример кода для извлечения пиксельных данных из DICOM файлов: