Интернет-журнал "Домашняя лаборатория", 2007 №7
Шрифт:
ribonuclease А — рибонуклеаза А. Рибонуклеаза, действующая на 3'-фосфатную группу пиримидинового основания и гидролизующая его фосфодиэфирную связь с 5'-фосфатной группой соседнего нуклеотида; в результате образуются пиримидин-3'-фосфаты и олигонуклеотиды, оканчивающиеся пиримидин-5'-фосфатом.
ribonuclease D — рибонуклеаза D. Экзонуклеаза <exonuclease>, участвующая в процессинге предшественника тРНК типа I, осуществляет отщепление по одному нуклеотиду с 3'-конца молекулы до достижения тринуклеотида ЦЦА, присутствующего у всех зрелых молекул тРНК.
ribonuclease inhibitor — ингибитор
ribonuclease Р — рибонуклеаза Р. Прокариотический фермент (например, известен у Е. coli и Bacillus subtilis); состоит из белкового компонента и РНК, которая в 5 раз превышает по массе белковый компонент; Р.Р осуществляет процессинг предшественников тРНК, при этом РНК-компонент Р.Р сам по себе обладает каталитической активностью, а белковый компонент без РНК не активен.
ribonuclease TI — рибонуклеаза TI. Рибонуклеаза, действующая на 3'-фосфатную группу гуанина и гидролизующая его связь с 5'-фосфатной группой соседнего нуклеотида, в результате чего образуются гуанозин-3'-фосфаты и олигонуклеотиды, оканчивающиеся гуанозин-5'-фосфатом; кроме того, у Е. coli известны следующие Р.:
BN — экзонуклеаза, субстрат — 3'-конец тРНК,
D — экзонуклеаза (кодируется геном ind), субстрат тот же,
Т — экзонуклеаза, субстрат — ЦЦА-тРНК,
III — эндонуклеаза (ген гпс), субстрат — рРНК и мРНК,
R — экзонуклеаза, субстрат тот же,
Е — эндонуклеаза (ген гпе), субстрат — 5S-pPHK,
I — эндонуклеаза (ген гпа), субстрат — большинство РНК,
II — экзонуклеаза (ген rnb), субстрат — неструктурированный 3'-конец РНК,
Н — эндонуклеаза (ген rnh), субстрат — гибриды РНК/ДНК.
ribonucleic acid, RNA — рибонуклеиновая кислота, РНК. Нуклеиновая кислота, состоящая из рибонуклеотидов, участвует в процессах реализации генетической информации; у некоторых вирусов в виде одно- или двухцепочечных молекул может быть основным носителем наследственной информации (в отсутствии молекул ДНК); синтез РНК происходит путем транскрипции с участием фермента РНК-полимеразы <RNA polymerase>; различают 3 основных типа РНК: рибосомную <ribosome RNA>, транспортную <transfer RNA> и информационную (матричную) РНК <mRNA>; у эукариот известна также низкомолекулярная ядерная РНК; у эукариот молекулы РНК, как правило, транскрибируются в виде больших молекул (предшественников — про-РНК), а затем путем сплайсинга <splicing> и др. посттранскрипционных модификаций <posttranscriptional modifications> преобразуются в активные (зрелые) формы, имеющие меньшие (иногда существенно меньшие) размеры.
ribonucleoprotein, RNP — рибонуклеопротеин, РНП. Комплекс РНК и белка; среди Р. наибольшей функциональной значимостью обладают информосомы <informosome>, а также РНП-частицы, участвующие в процессинге мРНК (сплайсомы <spliceosome>,
ribonucleotide — рибонуклеотид. Нуклеотид, содержащий рибозу, одно из азотистых оснований (включая редкие основания <rare bases>) и 1 или несколько остатков фосфорной кислоты.
ribophorin — рибофорин. Высококонсервативный гликопротеин, участвующий в связывании рибосом на мембранах шероховатого эндоплазматического ретикулюма: молекулярная масса Р. человека — 68 кД, он кодируется геном, локализованным на длинном плече хромосомы 3.
ribose — рибоза. Моносахарид из группы пентоз; Р. в фуранозной (циклической) форме входит в состав РНК, некоторых коферментов и бактериальных полисахаридов.
ribosomal cistron — рибосомный цистрон. Цистрон, содержащий гены рибосомной РНК; у Е. coli в состав Р.ц. (обозначается ггп) входят гены 16S-, 23S- и 5S-рРНК, в спейсерах между которыми расположены 2 гена, кодирующие тРНК.
ribosomal precursor RNA = preribosomal RNA (см.).
ribosomal protein — рибосомный белок. Белок, входящий в состав рибосом; 20–30 молекул Р. б. связывается с рибосомной РНК, образуя большую или малую субчастицы рибосомы.
ribosomal RNA, rRNA — рибосомная РНК, рРНК. РНК, входящая в состав рибосом (у прокариот молекулы рРНК 3 типов, а у эукариот — 4, различающихся константами седиментации, — например, у Е. coli 5S, 16S и 23S, у многих эукариот 5S, 8S, 18S и 28S); рРНК кодируется генами, локализованными в районе ядрышкового организатора <nucleolar organizer> (в интерфазе образующем ядрышко).
ribosome, Palades' granule — рибосома, тельце Паладе. Органелла клетки, рибонуклеопротеидная частица, с участием которой осуществляется биосинтез белка (трансляция <translation>); сама Р. обладает каталитической функцией, ответственной за образование пептидных связей, т. е. за полимеризацию аминокислотных остатков в полипептидную цепь белка; Р. состоит из двух (большой и малой) субчастиц, для взаимодействия которых необходимы ионы магния; размер Р. около 20 нм; эукариотические и прокариотические Р. различаются по размерам и константам седиментации: бактерии и хлоропласты — 70S у целой P., 50S (23S-pPHK) у большой и 30S (16S-pPHK) у малой субчастиц, цитоплазматические Р. растений — 80S, 60S соответственно, цитоплазматические Р. животных — 80S, (18S-pPHK), митохондриальные Р.
– 81S, 61S (25S-pPHK) временно могут образовывать полирибосомы <polysome>.
ribosome-binding site = Shine-Dalgarno sequence (см.)
5-ribosyl uracil = pseudouridine (см.).
ribothymidine — риботимидин. Редкое основание, транспортных РНК. 25S-pPHK) и 40S (16S-pPHK) 60S (29S-pPHK) и 40S и 47S (19S-pPHK); P. входящее в состав о
ribozymes — рибозимы. Молекулы РНК, обладающие ферментативной активностью (как правило, свойством автокатализа); впервые Р. были охарактеризованы при исследовании процессов аутосплайсинга <autosplicing> предшественника 26S-pPHK у инфузории Tetrahymena thermophila.