Мир до нас: Новый взгляд на происхождение человека

Хайэм Том

96

Hagelberg, E., Hofreiter, M. and Keyser, C. 2015. Ancient DNA: The First Three Decades. Philosophical Transactions of the Royal Society B 370: 2013.0371.

97

Cooper, A. and Poinar, H. N. 2000. Ancient DNA: Do It Right or Not at All. Science 289:1139.

98

Madison, P. 2016. The Most Brutal of Human Skulls: Measuring and Knowing the First Neanderthal. British Journal for the History of Science 49(3): 411–32.

99

Cooper, A. et al. 2001. Human Origins and Ancient Human DNA. Science 292: 1655–6.

100

Dabney, J., Meyer, M. and Paabo, S. 2013. Ancient DNA Damage. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology 5(7): a012567. https://doi.org/10.1101/cshperspect.a012567.

101

Gansauge, M.-T. and Meyer, M. 2014. Selective Enrichment of Damaged DNA Molecules for Ancient Genome Sequencing. Genome Research 24(9): 1543–9.

102

Korlevic, P. et al. 2015. Reducing Microbial and Human Contamination in DNA Extractions from Ancient Bones and Teeth. BioTechniques 59(2): 87–93.

103

Муллис

был интересной и непростой личностью. Он утверждал, что в его работе очень важную роль играли вещества, а в автобиографии «Пляски нагишом на поле разума» (Dancing Naked in the Mind Field) писал о том, как встретил возле своей лесной хижины зеленого енота в перчатках, вероятно пришельца из иных миров, который поприветствовал его словами: «Добрый вечер, доктор». Идея ПЦР пришла к нему в виде классического озарения в духе «Эврика!», когда поздно ночью он ехал из Беркли в свою хижину по калифорнийской автостраде 128. Он съехал на обочину около столба с обозначением «миля 46.58» и записал свои мысли, пока его девушка спала на соседнем сиденье. Он понял, что метод ПЦР может открыть широчайшие перспективы, так как позволяет амплифицировать огромное количество ДНК. В ту ночь он решил, что когда-нибудь непременно получит Нобелевскую премию за свое открытие. Увы, заключительный этап его научной карьеры был отмечен отрицанием климатических изменений и ложной идеей о том, что ВИЧ не порождает СПИД.

104

Green, R. E. et al. 2010. A Draft Sequence of the Neandertal Genome. Science 328: 710–22.

105

Общее описание см. здесь: www.yourgenome.org/facts/what-is-the-454-method-of-dna-sequencing.

106

Rasmussen, M. et al. 2010. Ancient Human Genome Sequence of an Extinct Palaeo-Eskimo. Nature 463: 757–62.

107

Olalde, I. et al. 2018. The Beaker Phenomenon and the Genomic Transformation of Northwest Europe. Nature 555: 190–96.

108

Paabo, S. 2014. Neanderthal Man: In Search of Lost Genomes. New York: Basic Books.

109

Там же.

110

Krause, J. et al. 2010. The Complete Mitochondrial DNA Genome of an Unknown Hominin from Southern Siberia. Nature. 464: 894–7.

111

Reich, D. et al. 2010. Genetic History of an Archaic Hominin Group from Denisova Cave in Siberia. Nature 468: 1053–60.

112

Meyer, M. et al. 2012. A High-Coverage Genome Sequence from an Archaic Denisovan Individual. Science 338: 222–6.

В геномах с высоким покрытием последнее обычно бывает больше 20X. Среди древних геномов рекорд принадлежит шведскому мезолитическому геному с археологической стоянки Стора Фёрвар, покрытие которого составляет 70X (Torsten Gunther et al., PLoS Biology 2018). Среди наших древнейших палеолитических образцов особняком стоит кость «алтайского неандертальца», «Денисова 5», по которой был составлен геном с выдающимся покрытием в 52X. Такого уровня не достигает даже большинство геномов с высоким покрытием, составленных для наших современников. Например, геном Крейга Вентера, руководителя одной из двух групп, соревновавшихся за первенство в деле секвенирования человеческого генома, имеет покрытие всего лишь 7,5X.

113

Green, R. E. et al. 2010. A Draft Sequence of the Neandertal Genome. Science 328: 710–22.

114

Bennett, E. A. et al. 2019. Morphology of the Denisovan Phalanx Closer to Modern Humans Than to Neanderthals. Science Advances, 4 сентября 2019 г.: eaaw3950.

115

Meyer et al. 2012.

116

Prufer, K. et al. 2017. A High-Coverage Neandertal Genome from Vindija Cave in Croatia. Science 358: 655–8.

117

Green et al. 2010.

118

Reich, D. et al. 2010.

119

Sawyer, S. et al. 2015. Nuclear and Mitochondrial DNA Sequences from Two Denisovan Individuals. Proceedings of the National Academy of Sciences 112: 15696–700.

120

Prufer, K. et al. 2017. A High-Coverage Neandertal Genome from Vindija Cave in Croatia. Science 358: 655–8.

121

Bennett, E. A. et al. 2019. Morphology of the Denisovan Phalanx Closer to Modern Humans Than to Neanderthals. Science Advances, 4 сентября 2019 г.: eaaw3950.

122

Reich, D. et al. 2010. Genetic History of an Archaic Hominin Group from Denisova Cave in Siberia. Nature 468: 1053–60.

123

См.: Meyer, M. et al. 2012. A High-Coverage Genome Sequence from an Archaic Denisovan Individual. Science 338: 222–6. Анализ позаимствован из: Viola, B. et al. Morphology of the Denisova Molar and Phalanx. Stratigraphy and Dating (Supplementary Information 12).

124

Arnold, L. J. et al. 2014. Luminescence Dating and Palaeomagnetic Age Constraint on Hominins from Sima de los Huesos, Atapuerca, Spain. Journal of Human Evolution 67: 85–107.